Научноприложният център по военна епидемиология и хигиена разполага с модерна апаратура и богати диагностични възможности. Това позволява от и в звеното да се извършват редица дейности по контрол, анализ и превенция:

1. Етиологична диагноза на бактериални, вирусни и паразитни заболявания. Лабораторен контрол на микробиологични показатели на питейна вода, въздух, храни;
2. Измервания на физични фактори и химични агенти в работната среда;
3. Ведомствен здравен контрол на радиационни параметри на работната среда;
4. Вземане на проби от храни и извършване на анализи, изпитвания и диагностика за целите на контрола;
5. Контрол по събирането, съхранението и извозването на болничните отпадъци;
6. Провеждане на профилактични и огнищни дезинфекционни, дезинсекционни и дератизационни мероприятия;
7. Изработване на процедури по пускане на обекти в експлоатация;
8. Контрол върху разпространението на COVID-19 при военнослужещи и цивилни служители на МО - пробовземане за тестване по методиката PCR, бързи антигенни тестове, налагане/отмяна на карантина при доказани случаи, извеждане от експлоатация на обекти;
9. Сертифициране на новоразкрита лаборатория за PCR диагностика, в отделение ,,Превантивна медицина” (ОПМ) - Варна към НПЦВЕХ-ВМА и предстоящи откривания на такива лаборатории към ОПМ - Пловдив и ОПМ - Сливен към НПЦВЕХ-ВМА;
10. Участие в научни проекти на национално и международно ниво по линия на епидемиологичният контрол;
11. Публикуване на получените резултати в специализираните медицински издания.